Para o desenvolvimento das suas actividades, desde a sua criação até o momento, o Centro contou com apoio externo de diversos parceiros de cooperação. Até o ano de 2013, por exemplo, os cursos de formação inicial foram inteiramente financiados com fundos disponibilizados por parceiros externos. Além das actividades pedagógicas, o CFJJ realizou uma sárie de outras actividades igualmente relevantes. Para mais detalhes, consulte a lista dos principais Projectos e actividades específicas realizados com o apoio dos parceiros de cooperação
Veja abaixo a lista dos parceiros de cooperação com os quais o CFJJ estabeleceu relações desde a sua criação.
• Associação Moçambicana de Bibliotecas Académicas e de Pesquisa (AMOBAP)
• Instituto Nacional de Normalização e Qualidade (INNOQ)